Detecção e identificação genética de pestivírus de bovinos
Resumo
O gênero Pestivirus, pertencente à família Flaviviridae, compreende três espécies virais que infectam bovinos: vírus da diarreia viral bovina 1 (BVDV-1)/Pestivirus A, BVDV-2/ Pestivirus B e pestivirus HoBi-like (HoBiPeV)/Pestivirus H. As duas espécies de BVDV e o HoBiPeV – assim como genótipos/subgenótipos - são identificados com base na comparação da região 5’ não-traduzida do genoma (5’UTR), que ainda permite agrupar os isolados nos 21 subgenótipos de BVDV-1 (-1a a -1u), quatro subgenótipos de BVDV-2 (-2a a -2d) e quatro do HoBiPeV (-3a a -3d). A região 5’UTR também é utilizada para a detecção molecular de pestivírus em amostras clínicas, pois é muito conservada. Em um primeiro estudo, descreve-se a detecção e identificação genética de pestivírus de 73 lotes de soro fetal bovino (SFB) de origem brasileira, produzidos entre os anos de 2006 e 2014. Trinta e nove lotes de SFB (53,4%) foram positivos na RT-PCR para pestivírus. Trinta e quatro lotes (46,6%) continham RNA do BVDV-1, sendo 23 -1a, oito -1b e três -1d. Seis lotes (8,2%) continham BVDV-2, sendo dois -2a, três -2b e um de subgenótipo indeterminado. Quatro lotes de SFB (5,5%) estavam contaminados com o vírus HoBiPeV e cinco lotes (6,8%) continham mais de um pestivírus. Estes resultados demonstram a contaminação de SFB de origem brasileira com RNA de pestivírus. O segundo estudo, relata a caracterização de 90 pestivírus obtidos de amostras de soro de bovinos no estado do Rio Grande do Sul, destinados à exportação no de 2017, sendo 38 BVDV-1 (42,2%), 31 BVDV-2 (34,4%) e 21 HoBiPeV (23,4%). Das amostras de BVDV-1, apenas os subgenótipos -1a (n = 28, 31,1%) e -1b (n = 10, 11,1%) foram identificados. Todos os 30 isolados de BVDV-2 pertenciam ao subgenótipo -2b e os 21 HoBiPeV foram agrupados no subgrupo 3a. O terceiro estudo, descreve a utilização de um novo par de primers (BP189-389) para detecção das três espécies de pestivírus de bovinos (BVDV-1, -2 e HoBiPeV). A RT-PCR com o primer 324 - 326 detectou 110 amostras positivas, sendo 62 para BVDV-1, 38 para BVDV-2 e 10 para HoBiPeV; e o primer 90 - 368 detectou 97 amostras positivas (64 BVDV-1; 33 BVDV-2). O primer específico para BVDV-2 detectou 45 amostras positivas (incluindo 38 detectadas pelo 324 - 326 e 33 pelo 90 - 368); enquanto que a RT-PCR utilizando o primer específico para HoBiPeV detectou 26 amostras positivas (incluindo 10 detectadas com o 324 - 326). A RT-PCR utilizando o primer BP189-389 detectou todas as 135 amostras, incluindo os 26 HoBiPeV detectados pelo N2-R5. Assim, o primer BP189 – 389 demonstrou alta sensibilidade e especificidade na detecção de BVDV-1, BVDV-2 e HoBiPeV, e pode ser uma alternativa no diagnóstico de pestivírus de bovinos. Em resumo, o presente trabalho apresenta contribuições para o diagnóstico de pestivírus bovino e acrescenta informações acerca do perfil genético dos pestivírus circulantes em bovinos no RS.
Coleções
Os arquivos de licença a seguir estão associados a este item: