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dc.creatorTrentin, Luana Belo
dc.date.accessioned2021-02-01T20:45:04Z
dc.date.available2021-02-01T20:45:04Z
dc.date.issued2019-07-16
dc.identifier.urihttp://repositorio.ufsm.br/handle/1/20283
dc.description.abstractWe described a novel baculovirus isolated from the polyphagous insect pest Rachiplusia nu. The virus presented pyramidal-shaped occlusion bodies (OBs) with singly-embed nucleocapsids and a dose mortality response of 6.9 × 103OBs/ml to third-instar larvae of R. nu. The virus genome is 128,587 bp long with a G + C content of 37.9% and 134 predicted ORFs. The virus is an alphabaculovirus closely related to Trichoplusia ni single nu-cleopolyhedrovirus, Chrysodeixis chalcites nucleopolyhedrovirus, and Chrysodeixis includens single nucleopolyhedrovirus and may constitute a new species. Surprisingly, we found co-evolution among the related viruses and their hosts at species level. Besides, auxiliary genes with homologs in other baculoviruses were found, e.g. a CPD-photolyase. The gene seemed to be result of a single event of horizontal transfer from lepidopterans to alphabaculovirus, followed by a transference from alpha to betabaculovirus. The predicted protein appears to be an active enzyme that ensures likely DNA protection from sunlight.eng
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESpor
dc.languageporpor
dc.publisherUniversidade Federal de Santa Mariapor
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International*
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/*
dc.subjectGenômicapor
dc.subjectBaculovíruspor
dc.subjectAlphabaculoviruspor
dc.subjectRachiplusia nu nucleopolyhedroviruspor
dc.subjectFotoliasepor
dc.subjectGenomiceng
dc.subjectPhotolyaseeng
dc.titleGenômica comparativa de um baculovírus isolado da lagarta praga Rachiplusia nu (Guenée) (Lepidoptera: noctuidae)por
dc.typeDissertaçãopor
dc.description.resumoDescrevemos um novo baculovírus isolado da praga polífaga Rachiplusia nu. O vírus apresentou corpos de oclusão em forma de pirâmide (OBs) com um único nucleocapsídeos por envelope e uma dose de mortalidade de 6,9 × 103OBs / ml a larvas de terceiro instar de R. nu. O genoma do vírus possui 128.587 pb de comprimento, com um teor de G + C de 37,9% e 134 ORFs preditas. O vírus é um alphabaculovirus intimamente relacionado com Trichoplusia ni single nucleopolyhedrovirus, Chrysodeixis chalcites nucleopolyhedrovirus e Chrysodeixis includens nucleopolyhedrovirus. Surpreendentemente, encontramos co-evolução entre os vírus relacionados e seus hospedeiros em nível de espécie. Além disso, foram encontrados genes auxiliares com homólogos em outros baculovírus, por exemplo uma CPD fotoliase. O gene pareceu ser o resultado de um único evento de transferência horizontal de lepidópteros para alphabaculovírus, seguido por uma transferência de alfa para betabaculovírus. A proteína prevista parece ser uma enzima ativa que garante a proteção do DNA contra a luz solar.por
dc.contributor.advisor1Araújo, Daniel Mendes Pereira Ardisson de
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/5900778605189135por
dc.contributor.referee1Silva, Leonardo Assis da
dc.contributor.referee1Latteshttp://lattes.cnpq.br/3237224113438090por
dc.contributor.referee2Schuch, André Passaglia
dc.contributor.referee2Latteshttp://lattes.cnpq.br/4932611269622766por
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/6228751626532265por
dc.publisher.countryBrasilpor
dc.publisher.departmentBioquímicapor
dc.publisher.initialsUFSMpor
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Ciências Biológicas: Bioquímica Toxicológicapor
dc.subject.cnpqCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOQUIMICApor
dc.publisher.unidadeCentro de Ciências Naturais e Exataspor


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