dc.creator | Rodrigues, Daniela Teixeira | |
dc.date.accessioned | 2021-08-27T22:59:06Z | |
dc.date.available | 2021-08-27T22:59:06Z | |
dc.date.issued | 2020-08-21 | |
dc.identifier.uri | http://repositorio.ufsm.br/handle/1/22094 | |
dc.description.abstract | The southern armyworm (Spodoptera eridania) is native to the American tropics and is
considered a polyphagous pest of great economic importance in several crops of Brazil. In this work, a
new alphabaculovirus isolated from S. eridania was characterized at structural, biological and molecular
levels. The isolate belongs to the EMBRAPA-Soja virus colection (Londrina, PR) and received the name
Spodoptera eridania nucleopolyhedrovirus CNPSo-165 (SperNPV-CNPSo-165). Transmission and
scanning electron microscopy showed that the SperNPV-CNPSo-165 occlusion bodies have a
polyhedral shape with multiple virions per nucleocapsid. The virus demonstrated lethality for the third
instar of S. eridania and S. albula (Walker) larvae, but not for S. frugiperda (J.E. smith) at the tested
concentrations. The SperNPV-CNPSo-165 genome has 137,373 bp, 151 ORFs, 4 repetitive regions and
a G+C content of 42.8%. Phylogenetic analysis based on the 38 baculovirus core genes indicated that
the new virus is closely related to the common ancestor of isolates from other species within the
Spodoptera complex, including another isolate also from S. eridania (SperNPV-251). Surprisingly,
SperNPV-CNPSo-165 has a single copy of the odv-e66 gene, a bacterial homologue of chondroitin
lyase, while viruses closely related to SperNPV-CNPSo-165 have two copies. Therefore, the evolution
of odv-e66 in the Baculoviridae family was investigated. Thirteen deletions, sixteen acquisitions and
one duplication of odv-e66 were found among the genomes of the baculoviruses characterized until then.
The analysis suggest that the SperNPV-CNPSo-165 genome appears to have suffered independent loss
of one of the copies of the gene. Thus, studies related to the characterization and evolution of
baculoviruses can provide important information for the development and improvement of biological control tools. | eng |
dc.description.sponsorship | Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES | por |
dc.language | por | por |
dc.publisher | Universidade Federal de Santa Maria | por |
dc.rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International | * |
dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ | * |
dc.subject | Baculovirus | por |
dc.subject | Genômica | por |
dc.subject | Spodoptera eridania nucleopolyhedrovirus | por |
dc.subject | Biopesticida | por |
dc.subject | Condroitina liase | por |
dc.subject | Genomic | eng |
dc.subject | Biopesticide | eng |
dc.subject | Chondroitin lyase | eng |
dc.title | Caracterização de um alphabaculovírus infectivo para larvas de Spodoptera eridania (Cramer, 1782) (Lepidoptera: Noctuidae) e a evolução de um gene homólogo de condroitina liase em baculovírus | por |
dc.type | Dissertação | por |
dc.description.resumo | A lagarta-das-vagens (Spodoptera eridania) é nativa dos trópicos americanos e é considerada uma
praga polifágica de grande importância econômica em diversas culturas no Brasil. Neste trabalho, um
novo alphabaculovírus isolado de S. eridania foi caracterzado em níveis estrutural, biológico e
molecular. O isolado pertence à coleção de vírus da EMBRAPA-Soja (Londrina, PR) e recebeu o nome
de Spodoptera eridania nucleopolyhedrovirus isolado CNPSo-165 (SperNPV-CNPSo-165). Ensaios de
microscopia eletrônica de transmissão e varredura evidenciaram que os corpos de oclusão de SperNPVCNPSo-
165 apresentam formato poliédrico com múltiplos virions por nucleocapsídeo. O vírus
demonstrou letalidade para o terceiro instar de larvas de S. eridania e S. albula, mas não para S.
frugiperda nas concentrações testadas. O genoma de SperNPV-CNPSo-165 apresenta 137.373 pb, 151
ORFs, 4 regiões repetitivas e conteúdo de G+C de 42,8%. Análise filogenética baseada nos 38 genes
core de baculovírus indicou que o novo vírus está proximamente relacionado ao ancestral comum mais
recente de isolados de outras espécies dentro do complexo Spodoptera, incluindo um alphabaculovírus
isolado também de S. eridania (SperNPV-251). Surpreendentemente, o SperNPV-CNPSo-165 apresenta
uma única cópia do gene odv-e66, um homólogo bacteriano de condroitina liase, enquanto que os vírus
intimamente relacionados apresentam duas cópias. Portanto, a evolução da odv-e66 na família
Baculoviridae foi investigada. Treze deleções, dezesseis aquisições e uma duplicação da odv-e66 foi
encontrada entre os genomas dos baculovírus até então caracterizados. As análises sugerem que o
genoma do SperNPV-CNPSo-165 parece ter sofrido perda independente de uma das cópias do gene.
Dessa forma, estudos relacionados à caracterização e a evolução dos baculovírus podem fornecer
informações importantes para o desenvolvimento e aprimoramento de ferramentas de controle biológico. | por |
dc.contributor.advisor1 | Araújo, Daniel Mendes Pereira Ardisson de | |
dc.contributor.advisor1Lattes | http://lattes.cnpq.br/5900778605189135 | por |
dc.contributor.referee1 | Wolff , José Luiz Caldas | |
dc.contributor.referee2 | Souza, Marlinda Lobo de | |
dc.creator.Lattes | http://lattes.cnpq.br/3639456665776083 | por |
dc.publisher.country | Brasil | por |
dc.publisher.department | Bioquímica | por |
dc.publisher.initials | UFSM | por |
dc.publisher.program | Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas: Bioquímica Toxicológica | por |
dc.subject.cnpq | CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOQUIMICA | por |
dc.publisher.unidade | Centro de Ciências Naturais e Exatas | por |