Na Disciplina Produção Agroecológica Vegetal II, serão estudados os princípios relacionados ao manejo ecológico de pragas, de doenças e de plantas daninhas, visando à otimização da produção vegetal em sistemas agroecológicos. A disciplina, oferecerá embasamento para que os alunos tenham condições de reconhecer as principais espécies de insetos, de patógenos e de plantas daninhas que ocorrem nos principais cultivos agrícolas. Ainda, apresentará os princípios básicos que permitirão, aos alunos, decidir sobre o manejo ecológico de pragas, de doenças e de plantas daninhas, dentro dos preceitos agroecológicos.