Caracterização funcional e estrutural de elementos transponíveis (hAT) encontrados nos genomas de espécies de drosophila
Resumo
Elementos transponíveis (TEs) são sequências de DNA presentes em praticamente todos os organismos com genoma sequenciado que foram avaliados e apresentam como característica marcante a capacidade de se mobilizarem ou serem mobilizados. Essa mobilização normalmente reflete efeitos negativos para os genomas hospedeiros, o que gera uma tendência de que esses elementos sejam eliminados dos genomas. No entanto, a presença de TEs também podem representar vantagens adaptativas e estes podem ser mantidos nos genomas hospedeiros quando assumem alguma função biológica. A superfamília hAT de TEs é amplamente distribuída em plantas, animais e fungos. Apesar de ser uma das superfamílias de TEs mais estudadas, análises que avaliam atividade e interação desses TEs com os genomas onde estão hospedados ainda são escassos. Neste sentido, o objetivo geral desta tese foi contribuir para o entendimento estrutural, funcional e os processos evolutivos dos elementos hATs (hobo e Herves-like) presentes em espécies do gênero Drosophila, bem como investigar a influência dos minissatélites na atividade do elemento howilli1 de D. willistoni. A tese será dividida em três capítulos. O primeiro capítulo tem como objetivo específico contextualizar os TEs estudados utilizando uma revisão bibliográfica que aborde aspectos de classificação, evolução e funcionalidade dos TEs, bem como apresentar os objetivos geral e específicos da tese. O segundo capítulo tem como objetivo apresentar os resultados obtidos ao longo dos estudos e é composto por três artigos: o primeiro fornece uma análise do cenário evolutivo do elemento hobo em espécies de Drosophila utilizando como marcador os TPEs repeats; o segundo consiste na caracterização dos minissatélites encontrados no elemento howilli1 como potenciais formadores de miRNAs; o terceiro artigo consiste na analise de distribuição de elementos Herves-like em genomas de Drosophila. E o terceiro e último capítulo consiste nas discussões gerais e perspectivas.
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