Descrição de isolado clínico de Bordetella trematum por sequenciamento de genoma total
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2019-07-18Metadatos
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Bordetella trematum é um cocobacilo Gram-negativo encontrado em feridas, úlceras de pé
diabético, otite, peritonite e bacteremia. Usualmente não causa infecções em humanos, visto
que há poucos relatos de casos descritos na literatura, acometendo sobretudo pacientes
imunocomprometidos. A patogenicidade, ciclo de vida, reservatório e mecanismos de
resistência aos antimicrobianos de B. trematum são pouco elucidados. Os fatores de virulência
(FV) de uma bactéria são fundamentais para o estabelecimento de uma infecção. Sua
identificação possui importância no esclarecimento da patogênese bacteriana e interação com
o hospedeiro. Já o conhecimento acerca dos mecanismos de resistência aos antimicrobianos
tem papel fundamental na escolha da antibioticoterapia adequada a ser administrada ao
paciente, o que pode contribuir para um desfecho clínico favorável. Os objetivos desse
trabalho consistiram em relatar um caso raro de B. trematum em úlcera de pé diabético e
apresentar os casos já descritos por outros autores, comparando aos dados obtidos; pesquisar e
descrever a função de possíveis genes codificadores de fatores de virulência; pesquisar e
descrever a função de possíveis genes de resistência aos antimicrobianos, bem como avaliar o
fenótipo de resistência aos antimicrobianos do isolado clínico, correlacionando-o ao genótipo.
O isolado foi identificado pelo sistema VITEK 2, tendo sua identificação confirmada por
Matrix Assisted Laser Desorption Ionization-Time of flight mass spectometry (MALDI-TOF
MS) no sistema VITEK MS. Após, foi submetido a sequenciamento do genoma total (Whole
Genome Sequencing- WGS) pela tecnologia Illumina MiSeq, com posterior análise
bioinformática. A pesquisa dos genes de virulência e resistência aos antimicrobianos foi
realizada pela ferramenta ABRicate nas bases de dados Virulence Factors Database (VFDB)
e Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD). A susceptibilidade aos
antimicrobianos foi avaliada por microdiluição em caldo. Foram encontrados dezesseis genes
codificadores de fatores de virulência, cheA, cheW, cheY, fliI, fliN, fliQ, fliC, bplA, bplB,
bplC, bplD, iroN, mgtA, relA, mtrD e brkB. Esses genes estão envolvidos em diversas funções
na célula bacteriana, como quimiotaxia, motilidade, biossíntese do lipopolissacarídeo (LPS),
aquisição de ferro e magnésio, no remodelamento do metabolismo bacteriano, na expressão
de bombas de efluxo e na resistência à morte celular mediada pelo sistema complemento.
Mais estudos são necessários para avaliar a expressão e funcionalidade desses genes. Na
análise de resistência, foram encontrados os genes macB, mdsB, mexI e ceoB, relacionados a
bombas de efluxo. No teste de susceptibilidade aos antimicrobianos (TSA), apenas o
aztreonam apresentou concentração inibitória mínima (CIM) elevada (>16μg/mL). A ausência
do gene ftsI, que codifica a proteína de ligação a penicilina 3 (penicillin-binding protein 3-
PBP3), alvo de ação do aztreonam, pode estar relacionada a esse fenótipo. As bombas de
efluxo encontradas não estão relacionadas à resistência aos β-lactâmicos. São necessários
estudos adicionais para determinar o impacto da ação dessas bombas de efluxo na resistência
aos antimicrobianos em B. trematum.
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