Caracterização dos genes que codificam selenoproteínas em peixe-zebra (Danio rerio)
Fecha
2020-02-21Primeiro coorientador
Araújo, Daniel Mendes Pereira Ardisson de
Primeiro membro da banca
Schuch, André Passaglia
Segundo membro da banca
Folmer, Vanderlei
Metadatos
Mostrar el registro completo del ítemResumen
As selenoproteínas são proteínas contendo selenocisteína (Sec) que exibem inúmeras funções fisiológicas, incluindo manutenção da homeostase redox, metabolismo dos hormônios da tireóide, transporte de selênio e atividades do tipo chaperona. Comparado a outros vertebrados, o peixe-zebra apresenta o maior número de genes codificadores de selenoproteínas identificados até o momento, e quase todas as selenoproteínas encontradas em humanos estão presentes nos peixes. Apesar disso, a variedade de selenoproteínas no peixe-zebra é pouco explorada. Para identificar alvos em potencial para estudos translacionais, foi analizado o status transcricional dos genes de selenoproteínas em diferentes tecidos e estágios da vida do peixe-zebra. Usando o conjunto de dados RNA-seq dos experimentos em Sequence Reads Archive (SRA) publicados no DNA Data Bank of Japan (DDBJ), foram determinados os níveis transcricionais das 37 sequências codificadoras de selenoproteínas em cérebro, coração, brânquias, fígado e músculo esquelético, comparando-os ao longo de diferentes idades. Os genes que codificam as selenoproteínas de peixe-zebra foram confirmados pela presença da estrutura SECIS na região não traduzida 3' dos mRNAs que codificam a selenoproteínas. Dos 37 genes das selenoproteínas analisados aqui, não foi encontrada uma sequência SECIS para o gene da selenoproteína J (selenoj). No geral, as consultas ao transcriptoma mostraram que todos os genes de selenoproteínas são ativamente transcritos nos tecidos analisados, com exceção do gene para selenoproteína E (selenoe). A pesquisa com RNA-seq revelou também que o cérebro é o tecido com maior diversidade de selenoproteínas, e que a transcrição de 20 genes varia de acordo com a idade, atingindo um pico no nível de transcrição no cérebro de peixe-zebra aos 16 meses de vida. Coletivamente, os dados do presente estudo identificam o peixe-zebra e, especialmente, o cérebro de peixes-zebra adultos como potencial tecido modelo para estudos sobre selênio e selenoproteínas, focando particularmente nos genes dio2, gpx1a, gpx4a, gpx4b, msrb1b, selenof, selenop, selenot1a, selenot2 selenow1 e selenow2a como alvos em futuros estudos translacionais.
El ítem tiene asociados los siguientes ficheros de licencia: