Descrição Booleana para eventos celulares: construção de redes, topologia e análise dinâmica
Abstract
Este trabalho apresenta uma metodologia para descrever a dinâmica e a
topologia de redes biológicas regulatórias através da aplicação da teoria de grafos,
da modelagem de redes a partir de regras booleanas e através do uso de
simulações baseadas em algoritmos implementados no software MATHEMATICA
7.0. Por meio desta metodologia procurou-se caracterizar a rede de regulação de
abertura e fechamento dos estômatos de uma planta pelo ácido abscísico (ABA),
incluindo a relação entre os elementos da rede durante a dinâmica e a descrição do
espaço de estados. No estudo do estado celular de senescência replicativa em
humanos, o objetivo é descrever uma rede regulatória de proteínas envolvendo os
mecanismos do complexo de Shelterin com a sinalização de duplas quebras no DNA
e a sinalização da parada do ciclo celular na fase G1. Por meio desta rede, a
topologia deve envolver a combinação de vias e módulos para garantir a
estabilidade da sinalização e a parada permanente da célula no estado senescente.
O estado senescente também é caracterizado pelo estabelecimento de um fenótipo
secretor (SASP) com efeitos tanto benéficos quanto prejudiciais para o organismo.
Diferentes vias estão identificadas juntamente com a ativação de NF-kB na
regulação deste fenótipo e nesse sentido, uma rede regulatória do SASP em
senescência replicativa é proposta e as principais consequências do SASP para o
cólon humano são identificadas através da análise de dados de microarranjos que
relacionam cólon normal, cólon inflamado, adenoma de cólon e carcinoma de cólon.