Show simple item record

dc.creatorRossato, Veronica Venturini
dc.date.accessioned2019-05-08T14:30:44Z
dc.date.available2019-05-08T14:30:44Z
dc.date.issued2017-08-29
dc.identifier.urihttp://repositorio.ufsm.br/handle/1/16459
dc.description.abstractMany factors may cause damages to the DNA, among them we can quote environmental pollution, ionizing radiations, amongst others. The signalization involved after an instituted damage consists in activation pathways and/or inhibitions, and the cellular answers after the damage include a removal of it, activation of cell cycle checkpoints, senescence or apoptosis. All of these processes are ruled by specific proteins that perform their functions to ensure that the stages of the cellular cycle are completed before the cellular division. Many studies suggest that senescent cells release factors that induce permanent senescence as a bystander effect in the cellular environment. These factors are known as SMS (Senescence-messaging secretome), and among it, TGF is a component involved in the called “senescence bystander”. This work deals with a proposed regulatory network for the interaction between proteins involved in the pathways of DNA damage responses and proteins involved in TGF pathway signaling, in addition to a protein interaction network proposed by Mombach et al. 2015. In the logical model proposed here, the variables that represent the proteins are discrete and the interactions between them are represented by logical operators (AND, OR and NOT) used in the rules of interactions. The inputs of the models are: expression of the TGF pathway in different levels, single strand breaks or doubles of the DNA (SSB – Single Strand Breaks and DSB – Double Strand Breaks) reparable or irreparable, and as outputs we have the phenotypes of senescence, apoptosis, cell cycle arrest and proliferation. The network was submitted to mutations simulating loss and gain of protein functions using the GINsim 2.9.4 software. These simulations show consistency with experimental works in phenotypes of cellular growth obtained from mutant cells. We observed as well the effect of synergy of the inputs of the system, which gave us as answer an increase of induction of senescence and cellular apoptosis. Approach the different functions of the TGF pathway in synergy with proteins involved in the DNA damage signaling, as well as evaluate the phenotypes occasioned by this combinations of interactions may be important therapeutic strategies in the treatment of pathologies, for example cancer.eng
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESpor
dc.languageporpor
dc.publisherUniversidade Federal de Santa Mariapor
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International*
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/*
dc.subjectModelo lógicopor
dc.subjectDano ao DNApor
dc.subjectSinalização TGFpor
dc.subjectDestino celularpor
dc.subjectFatores parácrinospor
dc.subjectLogical modeleng
dc.subjectDNA damageeng
dc.subjectTGF signalingeng
dc.subjectCell fateeng
dc.subjectParacrine factorseng
dc.titleModelo lógico da sinergia entre sinalização TGF_ e dano ao DNA no destino celularpor
dc.title.alternativeLogical model of synergy between TGF_ signaling and DNA damage in the cell fateeng
dc.typeTesepor
dc.description.resumoDiversos fatores podem ocasionar danos ao DNA, dentre eles podemos citar poluição ambiental, radiações ionizantes, dentre outros. A sinalização envolvida após um dano instaurado consiste em vias de ativação e/ou inibições, e as respostas celulares após o dano incluem a remoção do mesmo, ativação dos pontos de checagem do ciclo celular, senescência ou apoptose. Todos estes processos são regidos por proteínas específicas que desempenham suas funções para garantir que as etapas do ciclo celular sejam cumpridas anteriormente a divisão celular. Vários estudos sugerem que células senescentes liberam fatores que induzem senescência permanente como um efeito bystander no ambiente celular. Estes fatores são conhecidos como SMS (Senescense-messaging secretome) e dentre eles, TGF é um componente envolvido na chamada “senescência bystander”. Este trabalho trata-se de uma proposta de rede regulatória de interação entre proteínas envolvidas nas vias de respostas ao dano no DNA e proteínas envolvidas na sinalização da via de TGF , em adição a uma rede de interação de proteínas proposta por Mombach e colaboradores em 2015. No modelo lógico proposto aqui, as variáveis que representam as proteínas são discretas e as interações entre as mesmas são representadas por operadores lógicos (AND, OR e NOT) utilizados nas regras de interações. As entradas do modelo são: expressão da via TGF em diferentes níveis, quebras simples ou duplas do DNA (SSB - Single Strand Breaks e DSB - Double Strand Breaks) reparáveis ou irreparáveis, e como saída do modelo temos os fenótipos de senescência, apoptose, parada do ciclo celular e proliferação. A rede foi submetida a mutações simulando perda e ganho de função das proteínas utilizando o software GINsim 2.9.4, estas simulações demonstraram consistência com trabalhos experimentais em fenótipos de crescimento celular obtidos a partir de células mutantes. Observamos também o efeito da sinergia dos inputs do sistema, os quais nos deram como resposta um aumento de indução de senescência e apoptose celular. Abordar as diferentes funções da via de TGF em sinergia com proteínas envolvidas na sinalização de dano ao DNA, bem como avaliar os fenótipos ocasionados por estas combinações de interações, podem ser importantes estratégias terapêuticas no tratamento de patologias, como por exemplo, câncer.por
dc.contributor.advisor1Mombach, Jose Carlos Merino
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/7661373078999069por
dc.contributor.referee1Góes, Evamberto Garcia de
dc.contributor.referee1Latteshttp://lattes.cnpq.br/9707943694941428por
dc.contributor.referee2Oliveira, Gilberto Orengo de
dc.contributor.referee2Latteshttp://lattes.cnpq.br/3128561437415578por
dc.contributor.referee3Zimmer, Fábio Mallmann
dc.contributor.referee3Latteshttp://lattes.cnpq.br/6328420212181284por
dc.contributor.referee4Librelotto, Giovani Rubert
dc.contributor.referee4Latteshttp://lattes.cnpq.br/0865997296771785por
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/1765812965709105por
dc.publisher.countryBrasilpor
dc.publisher.departmentFísicapor
dc.publisher.initialsUFSMpor
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Físicapor
dc.subject.cnpqCNPQ::CIENCIAS EXATAS E DA TERRA::FISICApor
dc.publisher.unidadeCentro de Ciências Naturais e Exataspor


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International
Except where otherwise noted, this item's license is described as Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International

O Manancial - Repositório Digital da UFSM utiliza a versão 4.1 do software DSpace.
Av. Roraima, 1000. Cidade Universitária "Prof. José Mariano da Rocha Filho".
Bairro Camobi. CEP: 97.105-900. Santa Maria, RS, Brasil.