dc.creator | Freitas, Carolina de Oliveira | |
dc.date.accessioned | 2021-07-01T13:57:12Z | |
dc.date.available | 2021-07-01T13:57:12Z | |
dc.date.issued | 2020-02-20 | |
dc.identifier.uri | http://repositorio.ufsm.br/handle/1/21286 | |
dc.description.abstract | The bovine pestiviruses, bovine viral diarrhea virus 1, 2 (BVDV-1, BVDV-2) and HoBi-like (HobiPeV) are
associated with several reproductive and clinical manifestations, producing important losses for the cattle
industry. Field isolates have a significant genetic and antigenic variability, especially in the envelope
glycoprotein E2. This variability may compromise molecular and immunological diagnosis and immunization
strategies. Thus, this study performed a genetic and antigenic analysis of 51 pestivirus isolates obtained from
beef cattle in Rio Grande do Sul, Brazil, in 2017. Initially, the isolates were identified by PCR and confirmed by
sequencing and phylogenetic analysis of the 5'UTR region of the genome, complementing an analysis previously
carried out in a more comprehensive region of the 5'UTR. Then, the isolates were submitted to reactivity assays
with 11 monoclonal antibodies (MAbs) to the E2 glycoprotein, followed by sequencing and analysis of the
domain A (DA) of the E2 ectodomain. Based on the phylogenetic analysis of the 5’UTR, 27 isolates were
identified as BVDV-1 (22 -1a and 5 of -1b), 23 as BVDV-2 (all as -2b) and one as HobiPeV(-3a). This subtyping
corresponded to a previous study that characterized the entire portion of 5'UTR. Sequence analysis (nucleotide
and amino acid) of the E2 DA domain identified several nucleotide and amino acid changes, mainly at
immunodominant sites subjected to binding by antibodies. The amino acid residues that presented the highest
variability were at sites: 695 and 782 on the bovine pestivirus genome. Fewer aa changes were also observed at
position 701 and 734. MAb binding assays revealed marked variability in most E2 epitopes. On the other hand,
some MAbs recognized almost all isolates, confirming the existence of highly conserved epitopes in E2, while
other MAbs recognized few or no isolates. Thus, the present study provides important information about the
genetic and antigenic variability of the E2 DA domain of bovine pestivirus. This information may be useful to
guide molecular an immunological diagnosis and for vaccine formulation as well. | eng |
dc.description.sponsorship | Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq | por |
dc.description.sponsorship | Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES | por |
dc.language | por | por |
dc.publisher | Universidade Federal de Santa Maria | por |
dc.rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International | * |
dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ | * |
dc.subject | Pestivirus | por |
dc.subject | BVDV | por |
dc.subject | Subtipagem | por |
dc.subject | Diversidade antigênica | por |
dc.subject | E2 | por |
dc.subject | Subtyping | eng |
dc.subject | Antigenic diversity | eng |
dc.title | Análise genética e antigênica do ectodomínio da glicoproteína E2 de pestivírus isolados de bovinos no Rio Grande do Sul, Brasil | por |
dc.title.alternative | Genetic and antigenic analysis of the da ectodomain of glycoprotein E2 of pestiviruses isolated of cattle from Rio Grande do Sul, Brazil | eng |
dc.type | Dissertação | por |
dc.description.resumo | Os pestivírus de bovinos, vírus da diarreia viral bovina 1 e 2 (bovine viral diarrhea virus, BVDV-1, BVDV-2) e
pestivírus Hobi-like (HoBiPeV) estão associados com várias manifestações clínicas e reprodutivas produzindo
perdas importantes para a bovinocultura. Os isolados de campo apresentam uma grande variabilidade genética e
antigênica, especialmente na glicoproteína E2 do envelope viral. Essa variabilidade pode comprometer o
diagnóstico molecular e/ou imunológico e estratégias de formulação vacinal e imunização. Assim, este estudo
realizou uma análise genética e antigênica de 51 isolados de pestivírus obtidos de bovinos de corte no Rio
Grande do Sul, Brasil, no ano de 2017. Inicialmente, os isolados foram identificados por PCR e confirmados por
sequenciamento e análise filogenética da região 5’UTR do genoma, complementando uma análise realizada
anteriormente em uma região mais abrangente da 5’UTR. A seguir, os isolados foram submetidos à testes de
reatividade com 11 anticorpos monoclonais (MAbs) para a glicoproteína E2, seguido do sequenciamento e
análise do domínio DA do ectodomínio da E2. A partir das sequências de nucleotídeos da região 5’UTR foram
identificados 27 isolados de BVDV-1 (22 de -1a e 5 de -1b), 23 isolados de BVDV-2 (todos -2b) e um isolado de
HobiPeV(-3a). Essa subtipagem correspondeu a um estudo anterior que caracterizou toda a porçao da 5'UTR. A
análise de sequências (nucleotídeos e aminoácidos) do domínio DA da E2 identificou várias alterações de
aminoácidos, observadas principalmente nos sítios imunodominantes, locais onde há uma maior exposição aos
anticorpos. Os resíduos que apresentaram maior variabilidade foram nas posições: 695 e 782 do genoma do
pestivírus bovino. Esses locais já haviam sido descritos anteriormente por apresentarem uma alta taxa de
mutações e trocas de aminoácidos, provavelmente por serem importantes epítopos e alvos de anticorpos. Em
menor número, foram observadas mutações na posição 701 e 734. Os testes de reatividade com MAbs revelaram
uma variabilidade marcante na maioria dos epítopos da E2. Enquanto alguns MAbs reconheceram quase todos os
isolados, confirmando a existência de epítopos altamente conservados na E2, vários MAbs reconheceram poucos
ou mesmo nenhum isolado. Assim, o presente estudo fornece informações importantes referentes a variabilidade
genética e antigênica do domínio DA da E2 entre isolados de campo de pestivírus bovinos. Essas informações,
por sua vez, podem ser úteis para o diagnóstico molecular, imunológico e também para embasar as estratégias de elaboração de vacinas. | por |
dc.contributor.advisor1 | Weiblen, Rudi | |
dc.contributor.advisor1Lattes | http://lattes.cnpq.br/7946350215388090 | por |
dc.contributor.referee1 | Lima, Marcelo de | |
dc.contributor.referee2 | Brum, Mário Celso Sperotto | |
dc.creator.Lattes | http://lattes.cnpq.br/8035791443547154 | por |
dc.publisher.country | Brasil | por |
dc.publisher.department | Medicina Veterinária | por |
dc.publisher.initials | UFSM | por |
dc.publisher.program | Programa de Pós-Graduação em Medicina Veterinária | por |
dc.subject.cnpq | CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::MEDICINA VETERINARIA | por |
dc.publisher.unidade | Centro de Ciências Rurais | por |