Um estudo comparativo de algoritmos de agrupamento de dados para dados de docagem molecular
Abstract
Em Bioinformática, tratamos com uma grande quantidade de dados do contexto da biologia,
buscando obter, a partir deles, informações valiosas. Desenho Racional de Fármacos é
uma área da bioinformática, a qual é desenvolvido a partir da interação entre duas moléculas,
chamadas Receptor e Ligante. Através de experimentos de simulação por Docagem Molecular,
busca-se o melhor posicionamento dessas duas moléculas buscando a melhor ligação possível
entre as duas. A qualidade desta ligação é medida pelo FEB - Energia livre de ligação. Através
dessas simulações, os melhores ligantes para um determinado receptor são testados in vitro
e uma nova droga pode surgir. Uma estratégia para melhor obter esses resultados é considerar
tanto o receptor como o ligante como estruturas flexíveis. Entretanto, ao considerar essa
flexibilidade, o custo computacional para experimentos de docagem torna-se muito alto. Nesse
sentido, o algoritmo 3D-Tri busca encontrar conformações promissoras para futuros experimentos
de docagem, a partir de uma estratégia de árvore de decisão, baseada em agrupamento de
dados. O objetivo do presente trabalho é tratar esse grande volume de dados, e contribuir para a
evolução do algoritmo 3D-Tri, através da análise de algoritmos de agrupamento de dados para
uma possível redução no tempo de execução de futuros experimentos de docagem molecular.
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